Установите приложение ВКонтакте, а также официальное приложение TOTP Аутентификатор — оно понадобится для генерации кодов. Доступна версия для iOS в App Store и для Android в Google Play.
Откройте ВКонтакте → Управление аккаунтом VK ID → Безопасность → Двухфакторная аутентификация

Выберите вариант «Приложение для генерации кодов» и нажмите кнопку «Продолжить». ВКонтакте выдаёт уникальный 16-значный секретный ключ. Не давайте его посторонним, чтобы не взломали аккаунт.

Ключ нужно добавить в установленное приложение-аутентификатор. Далее по ключу аутентификатор будет генерировать TOTP-коды для вашего аккаунта.

Введите ключ из аутентификатора в нужное поле во ВКонтакте. Обратите внимание на таймер: по истечении времени код изменится. Нужно успеть ввести его в ВКонтакте и нажать «Продолжить» до истечения таймера.

Готово. Теперь при входе в аккаунт нужно будет ввести логин, пароль и одноразовый TOTP-код из приложения.